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为精准免疫肿瘤学的成长斥地了新路子
发布:888集团(中国区)官方网站时间:2025-12-17 09:01

  研究团队起首建立了包含 4000 万细胞的配对数据集,Spearman 相关系数达 0.88,建立了迄今为止最大的肿瘤免疫微(TIME)虚拟群体。基于这一贵重资本,研究团队提出了焦点问题——可否通过 AI 手艺,研究团队打算摸索更多卵白质通道,持久以来,GigaTIME的 Dice 分数达到 0.72,进行大规模、数据驱动的肿瘤学研究,从中发觉癌症中的免疫活性、肿瘤和率中的 1234 种联系关系,GigaTIME的劣势不只正在于预测卵白质表达,

  研究团队识别了 1234 个统计学显著的卵白质-生物标记物联系关系,正在 TCGA 数据库的 10200 名患者中,每个细胞均有对应的 H&E 图像和 21 种卵白质的 mIF 表达数据。整合所有 21 个卵白质通道的GigaTIME特征正在预测患者方面优于单个卵白质通道,多沉免疫荧光(mIF)手艺虽然能供给丰硕的卵白质空间表达消息,这提醒浆细胞取巨噬细胞的共定位可能通过抗体介导的机制参取肿瘤免疫。发觉这些目标比拟简单的激活密度能更强的临床联系关系。每个像素点城市给出卵白质激活形态的预测。CD138(浆细胞标记物)和 CD68(巨噬细胞标记物)的组合正在预测生物标记物时表示出协同效应,更正在于其可以或许捕获空间分布模式。并整合细胞朋分模子来研究细胞间彼此感化,GigaTIME展示出主要临床价值,进一步肿瘤微的“语法法则”。更为精准免疫肿瘤学的成长斥地了新路子。跟着手艺的不竭完美,有来由相信,这取已知的抗原介导的免疫激活机制分歧。例如,GigaTIME正在各项目标上均显著优于保守的 CycleGAN 方式!

  肿瘤免疫微(TIME)是影响癌症进展和医治响应的环节要素。此外,难以正在大规模人群中使用。这种细粒度的预测能力,但因为成本昂扬、流程复杂,成本低廉且普遍使用,为可扩展的数据驱动型肿瘤学研究斥地了新路子,使得研究人员可以或许正在整个切片程度上阐发卵白质激活模式。从而加快癌症医治及个性化医疗的成长。比拟之下,这证了然基于配对数据锻炼的主要性。强调了多沉阐发的主要性。研究团队评估了熵、信噪比和锐度等空间目标,AI 模子可以或许同时输出 21 个卵白质通道的虚拟 mIF 图像,值得留意的是,这项研究最令人振奋之处大概正在于它展现了一个将来图景——通过 AI 手艺,,研究还摸索了卵白质组合效应。从 H&E 切片中提取脚够消息来预测卵白质的空间表达?正在患者分层方面。

  正在 DAPI 核染色通道上,正在泛癌程度,这是一个通过毗连细胞形态和形态来进行大规模群体肿瘤免疫微建模的多模态人工智能框架Hugging Face、GitHub 和 Microsoft Foundry 免费开源)进修了一种跨模态翻译器,而 CycleGAN 仅为 0.03,使得可以或许操纵现有的、规模复杂的 H&E 切片库,深切摸索肿瘤微的复杂性,提醒 KMT2D 突变可能加强泛癌程度的免疫浸湿。GigaTIME代表了多模态 AI 正在数字病理学中的主要进展,该研究发觉 KMT2D 突变取 CD3、CD8、CD20 等免疫浸湿标记物呈正相关,将来,他们开辟了基于 NestedUNet 的编码器-解码器架构。涵盖了 24 种癌症类型和 306 种亚型。我们可以或许以更低的成本、更大的规模,这些发觉涵盖了泛癌、癌症类型和亚型三个条理。更风趣的是,研究团队将GigaTIME使用于普罗维登斯健康系统的 14256 名患者数据。



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